Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP4P49662 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP4P49662 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP4P49662 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CASP4P49662 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CASP4P49662 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms