Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPARGP37231 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPARGP37231 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPARGP37231 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms