Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CASQ1P31415 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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CASQ1P31415 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CASQ1P31415 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
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