Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD27P26842 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD27P26842 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD27P26842 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD27P26842 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD27P26842 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD27P26842 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD27P26842 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms