Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CTNNA2P26232 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms