Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SFMBT2-204ENST00000397167 8024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 RERE-202ENST00000377464 6733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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