Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LYL1P12980 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LYL1P12980 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms