Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GLI3P10071 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GLI3P10071 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GLI3P10071 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms