Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC166P0CW27 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms