Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPR89BP0CG08 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms