Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GJB1P08034 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GJB1P08034 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms