Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CBX7O95931 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CBX7O95931 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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CBX7O95931 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX7O95931 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX7O95931 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX7O95931 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX7O95931 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX7O95931 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CBX7O95931 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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