Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYNMO15061 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYNMO15061 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYNMO15061 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYNMO15061 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYNMO15061 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms