Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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C9orf172C9J069 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf172C9J069 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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