Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HMGB1P1B2RPK0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms