Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C4orf47A7E2U8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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