Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
C9orf92A6NGG3 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KIAA0513-202ENST00000538274 7381 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PER3-208ENST00000613533 6318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms