Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC8Q9Y2L5 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms