Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
TNRC6BQ9UPQ9 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TNRC6BQ9UPQ9 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms