Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TUBE1Q9UJT0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TUBE1Q9UJT0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms