Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPC1L1Q9UHC9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms