Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RNF7Q9UBF6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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