Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HCN3Q9P1Z3 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms