Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM248Q9NWD8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms