Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHST12Q9NRB3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms