Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CIPCQ9C0C6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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