Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF17Q9BXT8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RNF17Q9BXT8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms