Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SYCP2Q9BX26 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SYCP2Q9BX26 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms