Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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PKP4Q99569 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PKP4Q99569 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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