Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

Predictions only

Length 1,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP47Q96K76 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP47Q96K76 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms