Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TM4SF18Q96CE8 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms