Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SPTSSAQ969W0 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SPTSSAQ969W0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SPTSSAQ969W0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SPTSSAQ969W0 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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SPTSSAQ969W0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SPTSSAQ969W0 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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