Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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GTF3C6Q969F1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GTF3C6Q969F1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
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