Protein–RNA interactions for Protein: Q93077

HIST1H2AC, Histone H2A type 1-C, humanhuman

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H2ACQ93077 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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HIST1H2ACQ93077 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HIST1H2ACQ93077 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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