Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC84Q86UT8 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCDC84Q86UT8 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms