Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HECW1Q76N89 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms