Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMARCD3Q6STE5 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMARCD3Q6STE5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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