Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
WASHC2DQ5SRD0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms