Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMEM259Q4ZIN3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms