Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CHD9Q3L8U1 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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CHD9Q3L8U1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CHD9Q3L8U1 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CHD9Q3L8U1 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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CHD9Q3L8U1 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CHD9Q3L8U1 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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