Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HADHQ16836 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
HADHQ16836 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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