Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ZFHX3Q15911 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms