Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CHD4Q14839 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CHD4Q14839 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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