Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPIDRQ14159 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPIDRQ14159 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms