Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DDX39BQ13838 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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