Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HDAC1Q13547 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HDAC1Q13547 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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