Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE3BQ13370 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
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