Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AP3B2Q13367 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms