Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTPN13Q12923 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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