Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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FOXO1Q12778 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXO1Q12778 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
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